Genómica & Bioinformática con Sounio
Sounio ofrece algoritmos básicos para transformaciones de secuencias.
Operadores de Secuencia
// Complementar una base individual (XOR con 0b11)
fn complement_base(b: u8) -> u8 {
return b ^ 3
}
// Complementar toda la secuencia
fn complement(seq: &[u8]) -> [u8] {
return seq.map(|b| b ^ 3)
}
// Complementar inverso
fn reverse_complement(seq: &[u8]) -> [u8] {
let rev = seq.reverse()
return rev.map(|b| b ^ 3)
}